Javascript מושבת כעת בדפדפן שלך.כאשר javascript מושבת, חלק מהפונקציות של אתר זה לא יפעלו.
רשום את הפרטים הספציפיים שלך ותרופות ספציפיות לעניין, ואנו נתאים את המידע שאתה מספק למאמרים במאגר המידע הנרחב שלנו ונשלח לך עותק PDF בדוא"ל בזמן.
מאפיינים קליניים ומולקולריים של Klebsiella pneumoniae, עמיד לקרבפנם, בבית חולים שלישוני בשנחאי
Zhou Cong, 1 Wu Qiang, 1 He Leqi, 1 Zhang Hui, 1 Xu Maosuo, 1 Bao Yuyuan, 2 Jin Zhi, 3 Fang Shen 11 המחלקה לרפואה מעבדתית קלינית, בית החולים החמישי לשנגחאי, אוניברסיטת פודן, שנגחאי, הרפובליקה העממית של שנגחאי. חרסינה;2 Shanghai Jiaotong המחלקה לרפואת מעבדה, בית החולים לילדים בשנחאי, שנגחאי, הרפובליקה העממית של סין;3 המחלקה לנוירולוגיה, בית החולים החמישי של שנגחאי, אוניברסיטת פודן מחבר מקביל: פאנג שן, המחלקה לרפואת מעבדה קלינית, בית החולים החמישי של שנגחאי, אוניברסיטת פודן, מס' 128 Ruili Road, Minhang District, שנחאי, מיקוד 200240 של ChinaTel +86 180210722 דוא"ל [מוגן בדוא"ל] רקע: המיזוג של עמידות לקרבפנם והיפר-ווירולנטיות ב- Klebsiella pneumoniae הוביל לאתגרים גדולים בבריאות הציבור.בשנים האחרונות, יש יותר ויותר דיווחים על מבודדים מסוג Klebsiella pneumoniae (CR-hvKP) עמידים לקרבפנם.חומרים ושיטות: ניתוח רטרוספקטיבי של הערכת הנתונים הקליניים של חולים שנדבקו ב-CR-hvKP מינואר 2019 עד דצמבר 2020 בבית חולים שלישוני.חשב את ה- Klebsiella pneumoniae, Klebsiella pneumoniae (hmKP), Klebsiella pneumoniae עמידים לקרבפנם (CR-hmKP) ודלקת ריאות עמידה ל-Carbapenem שנאספו תוך שנתיים מספר הבידודים של Leberella (CR-hvKP).זיהוי PCR של גנים עמידות, גנים הקשורים לאריפות, גנים של סרוטיפ קפסולרי והקפדה על רצף רב-לוקוסי (MLST) של מבודדים CR-hvKP.תוצאות: בסך הכל בודדו במהלך המחקר 1081 זני Klebsiella pneumoniae שאינם חוזרים על עצמם., כולל 392 זנים של Klebsiella pneumoniae (36.3%), 39 זנים של CR-hmKP (3.6%) ו-16 זנים של CR-hvKP (1.5%).כ-31.2% (5/16) מ-CR-hvKP יבודדו ב-2019, וכ-68.8% (11/16) מ-CR-hvKP יבודדו בשנת 2020. בין 16 זני CR-hvKP, 13 זנים ו-ST11 סרוטיפ K64, זן אחד הוא סרוטיפים ST11 ו-K47, זן אחד הוא סרוטיפים ST23 ו-K1, וזן אחד הוא סרוטיפים ST86 ו-K2.הגנים הקשורים ל-entB, fimH, rmpA2, iutA ו-iucA נמצאים בכל 16 הבידודים של CR-hvKP, ואחריהם mrkD (n=14), rmpA (n=13), אירובקטין (n=2) , AllS ( n=1).מבודדי 16 CR-hvKP נושאים כולם את הגן carbapenemase blaKPC-2 ואת הגן β-lactamase בעל הספקטרום המורחב blaSHV.התוצאות של טביעת אצבע של ERIC-PCR DNA הראו ש-16 זני CR-hvKP היו פולימורפיים מאוד, והרצועות של כל זן היו שונות באופן משמעותי, והראו מצב ספורדי.מסקנה: למרות שה-CR-hvKP מופץ באופן ספורדי, הוא גדל משנה לשנה.שָׁנָה.לכן, יש לעורר תשומת לב קלינית, ולנקוט באמצעים הכרחיים כדי למנוע שיבוט והפצה של superbug CR-hvKP.מילות מפתח: Klebsiella pneumoniae, עמידות לקרבפנם, ארסיות גבוהה, ריר גבוה, אפידמיולוגיה
Klebsiella pneumoniae הוא פתוגן אופורטוניסטי שיכול לגרום למגוון זיהומים, כולל דלקת ריאות, דלקות בדרכי השתן, בקטרמיה ודלקת קרום המוח.1 בשלושים השנים האחרונות, בניגוד ל-Klebsiella pneumoniae הקלאסי (cKP), ריר היפר-רירי חדש של Klebsiella pneumoniae (hvKP) הפך לפתוגן בעל חשיבות קלינית, אשר ניתן למצוא בזיהומים אגרסיביים מאוד כגון מורסות כבד נגרמות אצל בריאים ואנשים מדוכאי חיסון.2 ראוי לציין כי זיהומים אלו מלווים בדרך כלל בזיהומים מפוזרים הרסניים, לרבות אנדופתלמיטיס ודלקת קרום המוח.3 הייצור של פנוטיפ רירית רירית גבוה hvKP נובע בדרך כלל מייצור מוגבר של פוליסכרידים קפסולריים ונוכחות של גנים ארסיים ספציפיים, כגון rmpA ו-rmpA2.4.פנוטיפ הריר הגבוה נקבע בדרך כלל על ידי "בדיקת המיתרים".מושבות Klebsiella pneumoniae הגדלות בן לילה על לוחות אגר דם נמתחות עם לולאה.כאשר נוצר חבל צמיג באורך של>5 מ"מ, "בדיקת החבל" חיובית.5 מחקר שנערך לאחרונה הראה כי peg-344, iroB, iucA, rmpA rmpA2 ו-rmpA2 הם סמנים ביולוגיים שיכולים לזהות במדויק hvkp.6 במחקר זה, ה- Klebsiella pneumoniae הארסית ביותר הוגדרה כבעלת פנוטיפ צמיג רירי מאוד (תוצאת בדיקת מיתר חיובית) ונושאת אתרים הקשורים לפלסמיד ארסי של Klebsiella pneumoniae (rmpA2, iutA, iucA) בשנות השמונים, דיווחי המקרים של קהילת טייוואן תיארו לראשונה. -מורסות כבד נרכשות הנגרמות על ידי hvKP, מלוות בנזק חמור לאיבר הקצה, כגון דלקת קרום המוח ואנדופתלמיטיס.ל-7,8 hvKP יש שידור ספורדי במדינות רבות באסיה, אירופה ואמריקה.למרות שדווחו מספר מקרים של hvKP באירופה ובאמריקה, השכיחות של hvKP התרחשה בעיקר במדינות אסיה, במיוחד בסין.9
באופן כללי, hvKP רגיש יותר לאנטיביוטיקה, בעוד דלקת ריאות Klebsiella עמידה לקרבפנם (CRKP) פחות רעילה.עם זאת, עם התפשטות הפלסמידים של עמידות לתרופות ופלסמידים ארסים, CR-hvKP תואר לראשונה על ידי Zhang et al.בשנת 2015, ויש יותר ויותר דיווחים מקומיים.10 מכיוון ש-CR-hvKP יכול לגרום לזיהומים חמורים וקשים לטיפול, אם מופיע שיבוט מגיפה, הוא עלול להפוך ל"באג העל" הבא.עד כה, רוב הזיהומים שנגרמו על ידי CR-hvKP התרחשו במקרים ספורדיים, והתפרצויות בקנה מידה קטן הן נדירות.11,12
נכון לעכשיו, שיעור הזיהוי של CR-hvKP נמוך, ויש מעט מחקרים קשורים.האפידמיולוגיה המולקולרית של CR-hvKP שונה באזורים שונים, ולכן יש צורך ללמוד את ההתפלגות הקלינית ואת המאפיינים האפידמיולוגיים המולקולריים של CR-hvKP באזור זה.מחקר זה ניתח באופן מקיף את הגנים העמידות, הגנים הקשורים לאריפות ו-MLST של CR-hvKP.ניסינו לחקור את השכיחות והאפידמיולוגיה המולקולרית של CR-hvKP בבית חולים שלישוני בשנחאי, מזרח סין.למחקר זה יש משמעות רבה להבנת האפידמיולוגיה המולקולרית של CR-hvKP בשנחאי.
מבודדי Klebsiella pneumoniae שאינם חוזרים על עצמם מבית החולים העממי החמישי בשנחאי המסונף לאוניברסיטת פודן מינואר 2019 עד דצמבר 2020 נאספו בדיעבד, והאחוזים של hmKP, CRKP, CR-hmkp ו-CR-hvKP חושבו.כל המבודדים זוהו על ידי מנתח מיקרוביאלי קומפקטי VITEK-2 (Biomerieux, Marcy L'Etoile, צרפת).ספקטרומטריית מסה Maldi-Tof (Bruker Daltonics, Billerica, MA, ארה"ב) שימשה כדי לבדוק מחדש את הזיהוי של זני חיידקים.פנוטיפ הריר הגבוה נקבע על ידי "בדיקת המיתרים".כאשר אימיפנם או מרופנם עמידים, עמידות לקרבפנם נקבעת באמצעות בדיקת רגישות לתרופות.Klebsiella pneumoniae ארסית מאוד מוגדרת כבעלת פנוטיפ ריר גבוה (תוצאת בדיקת מיתר חיובית) ונושאת אתרים הקשורים לפלסמיד ארסי של Klebsiella pneumoniae (rmpA2, iutA, iucA)6.
מושבה אחת של Klebsiella pneumoniae חוסן על צלחת אגר של 5% דם כבשים.לאחר הדגירה למשך הלילה ב-37 מעלות צלזיוס, משוך בעדינות את המושבה עם לולאת חיסון וחזור 3 פעמים.אם נוצר קו צמיג שלוש פעמים והאורך גדול מ-5 מ"מ, "בדיקת הקו" נחשבת לחיובית, ולזן יש פנוטיפ ריר גבוה.
במנתח המיקרוביאלי הקומפקטי האוטומטי VITEK-2 (Biomerieux, Marcy L'Etoile, צרפת), זוהתה הרגישות האנטי-מיקרוביאלית למספר אנטיביוטיקה נפוצה על ידי דילול מיקרו של מרק.התוצאות מתפרשות על פי מסמך ההנחיות שפותח על ידי המכון לתקנים קליניים ומעבדתיים (CLSI, 2019).E. coli ATCC 25922 ו-Klebsiella pneumoniae ATCC 700603 שימשו כבקרות לבדיקת רגישות לאנטי-מיקרוביאלית.
DNA גנומי של כל הבידודים של Klebsiella pneumoniae הופק על ידי ערכת TIANamp Bacteria Genomic DNA (Tiangen Biotech Co. Ltd., בייג'ינג, סין).גנים עם ספקטרום מורחב של β-lactamase (blaCTX-M, blaSHV ו-blaTEM), גנים של קרבפנמז (blaKPC, blaNDM, blaVIM, blaIMP ו-blaOXA-48) ו-9 גנים מייצגים הקשורים ל-Virulence, כולל לוקוסים דמויי פלסמיד pLVPK (allS, fimH , mrkD, entB, iutA, rmpA, rmpA2, iucA ו- aerobactin) הוגברו על ידי PCR כפי שתואר קודם לכן.13,14 גנים ספציפיים לסרוטיפ קפסולרי (K1, K2, K5, K20, K54 ו-K57) הוגברו על ידי PCR כמתואר לעיל.14 אם שלילי, הגביר ורצף את הלוקוס של wzi כדי לקבוע את הגנים הספציפיים לסרוטיפ הקפסולרי.15 הפריימרים המשמשים במחקר זה מפורטים בטבלה S1.תוצרי ה-PCR החיוביים רוצו על ידי פלטפורמת הרצף NextSeq 500 (אילומינה, סן דייגו, קליפורניה, ארה"ב).השווה רצפי נוקלאוטידים על ידי הפעלת BLAST באתר NCBI (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi).
הקלדת רצף מרובה אתרים (MLST) בוצעה כמתואר באתר Pasteur Institute MLST (https://bigsdb.pasteur.fr/klebsiella/klebsiella.html).שבעת הגנים של משק הבית gapA, infB, mdh, pgi, phoE, rpoB ו-tonB הוגברו על ידי PCR ורצפו.סוג הרצף (ST) נקבע על ידי השוואת תוצאות הרצף עם מסד הנתונים של MLST.
ההומולוגיה של Klebsiella pneumoniae נותחה.ה-DNA הגנומי של Klebsiella pneumoniae הופץ כתבנית, והפריימרים של ERIC מוצגים בטבלה S1.PCR מגביר DNA גנומי ובונה טביעת אצבע של DNA גנומי.16 מוצרי PCR זוהו על ידי אלקטרופורזה של 2% אגרוז ג'ל.תוצאות טביעת אצבע של DNA זוהו באמצעות זיהוי פס של תוכנת QuantityOne, וניתוח גנטי בוצע באמצעות שיטת ה- Unweighted paired group (UPGMA) של ממוצע אריתמטי.המבודדים עם דמיון של> 75% נחשבים לאותו גנוטיפ, ואלו עם דמיון <75% נחשבים לגנוטיפים שונים.
השתמש בחבילת התוכנה הסטטיסטית SPSS עבור Windows 22.0 כדי לנתח את הנתונים.הנתונים מתוארים כממוצע ± סטיית תקן (SD).משתנים קטגוריים הוערכו על ידי מבחן צ'י ריבוע או מבחן מדויק של פישר.כל הבדיקות הסטטיסטיות הן דו-זנבות, וערך P של <0.05 נחשב מובהק סטטיסטית.
בית החולים העממי החמישי של שנחאי, המסונף לאוניברסיטת פודן, אסף 1081 מבודדים של Klebsiella pneumoniae מ-1 בינואר 2019 עד 31 בדצמבר 2020, והוציא מבודדים כפולים מאותו חולה.ביניהם, 392 זנים (36.3%) היו hmKP, 341 זנים (31.5%) היו CRKP, 39 זנים (3.6%) היו CR-hmKP ו-16 זנים (1.5%) היו CR-hvKP.ראוי לציין כי 33.3% (13/39) מ-CR-hmKP ו-31.2% (5/16) מ-CR-hvKP הם משנת 2019, 66.7% (26/39) מ-CR-hmKP ו-68.8% (11/16 ) ה-CR-hvKP הופרד משנת 2020. מליחה (17 זנים), שתן (12 זנים), נוזל ניקוז (4 זנים), דם (2 זנים), מוגלה (2 זנים), מרה (בידוד אחד) ותפליט פלאורלי (בידוד אחד), בהתאמה.שישה עשר סוגים של CR-hvKP נמצאו מליחה (9 מבודדים), שתן (5 מבודדים), דם (בידוד אחד) ותפליט פלאורלי (בידוד אחד).
באמצעות זיהוי זנים, בדיקת רגישות לתרופה, בדיקת מיתר וזיהוי גנים הקשורים לאריפות, נבדקו 16 זני CR-hvKP.המאפיינים הקליניים של 16 החולים שנדבקו בבידוד CR-hvKP מסוכמים בטבלה 1. 13 מתוך 16 החולים (81.3%) היו גברים, וכל החולים היו מבוגרים מ-62 שנים (גיל ממוצע: 83.1±10.5 שנים).הם הגיעו מ-8 מחלקות, ויותר ממחציתם הגיעו מהטיפול הנמרץ המרכזי (9 מקרים).מחלות בסיסיות כוללות מחלות מוחיות (75%, 12/16), יתר לחץ דם (50%, 8/16), מחלת ריאות חסימתית כרונית (50%, 8/16) ועוד. ניתוח פולשני כולל אוורור מכני (62.5%, 10/ 16), קטטר שתן (37.5%, 6/16), צינור קיבה (18.8%, 3/16), ניתוח (12.5%, 2/16) וצנתר תוך ורידי (6.3%, 1/16).תשעה מתוך 16 החולים מתו, ו-7 חולים השתפרו ושוחררו.
מבודדי 39 CR-hmKP חולקו לשתי קבוצות לפי אורך המיתר הדביק.ביניהם, 20 מבודדים CR-hmKP עם אורך מיתר צמיג ≤ 25 מ"מ חולקו לקבוצה אחת, ו-19 מבודדים CR-hmKP עם אורך מיתר צמיג> 25 מ"מ חולקו לקבוצה אחרת.שיטת PCR מזהה את השיעור החיובי של הגנים הקשורים לארסיות rmpA, rmpA2, iutA ו-iucA.השיעורים החיוביים של גנים הקשורים ל-CR-hmKP בשתי הקבוצות מוצגים בטבלה 2. לא היה הבדל סטטיסטי בשיעור החיובי של גנים הקשורים ל-CR-hmKP בין שתי הקבוצות.
טבלה 3 מפרטת את פרופילי העמידות המפורטים לאנטי-מיקרוביאלית של 16 התרופות.16 מבודדי CR-hvKP הראו עמידות לריבוי תרופות.כל המבודדים טופלו באמפיצילין, אמפיצילין/סולבקטם, צפופרזון/סולבקטם, פיפרצילין/טזובקטם, צפזולין, צפורוקסים, צפטאזידיים, צפטריאקסון, צפפים, צפקקסיטין, אימיפנם ומרופנם עמידים.ל-Trimethoprim-sulfamethoxazole היה שיעור העמידות הנמוך ביותר (43.8%), ואחריו אמיקאצין (62.5%), גנטמיצין (68.8%) וציפרלקס (87.5%).
ההפצה של גנים הקשורים לארס, גנים עמידות לאנטי-מיקרוביאלית, גנים סרוטיפ קפסולרי ו-MLST של 16 מבודדים של CR-hvKP מוצגת באיור 1. התוצאות של אלקטרופורזה של ג'ל אגרוז של כמה גנים הקשורים לאריפות, גנים של עמידות אנטי-מיקרוביאלית וגנים של סרוטיפ קפסולרי הם מוצג באיור 1. איור 2. ניתוח MLST מראה בסך הכל 3 STs, ST11 הוא ה-ST הדומיננטי ביותר (87.5%, 14/16), ואחריו ST23 (6.25%, 1/16) ו-ST86 (6.25%, 1 /16).על פי תוצאות ההקלדה של wzi, זוהו 4 סרוטיפים קפסולריים שונים (איור 1).מבין 16 מבודדי hvKP העמידים לקרבפנם, K64 הוא הסרוטיפ הנפוץ ביותר (n=13), ואחריו K1 (n=1), K2 (n=1) ו-K47 (n=1).בנוסף, זן הסרוטיפ הקפסולרי K1 הוא ST23, זן הסרוטיפ הקפסולרי K2 הוא ST86, ו-13 הזנים הנותרים של K64 וזן 1 של K47 הם כולם ST11.השיעורים החיוביים של 9 גנים ארסים ב-16 מבודדים של CR-hvKP מוצגים באיור 1. , הגנים הקשורים ל-entB, fimH, rmpA2, iutA ו-iucA נמצאים ב-16 זני CR-hvKP, ואחריהם mrkD (n = 14), rmpA (n=13), אירובקטרין (n=2), AllS (n=1).מבודדי 16 CR-hvKP נושאים כולם את הגן carbapenemase blaKPC-2 ואת הגן β-lactamase בעל הספקטרום המורחב blaSHV.16 מבודדי CR-hvKP לא נשאו גנים קרבפנם blaNDM, blaVIM, blaIMP, blaOXA-48 וגנים מורחב-ספקטרום β-lactamase blaTEM, blaCTX-M-2 וקבוצת blaCTX-M-8.מבין 16 זני CR-hvKP, 5 זנים נשאו את קבוצת הגן β-lactamase בעל הספקטרום המורחבת blaCTX-M-1, ו-6 זנים נשאו את קבוצת הגן β-lactamase המורחבת blaCTX-M-9.
איור 1 איור 1 הגנים הקשורים לאריסות, גנים של עמידות לאנטי-מיקרוביאלית, גנים של סרוטיפ קפסולרי ו-MLST של 16 מבודדים של CR-hvKP.
איור 2 איור 2 אלקטרופורזה של ג'ל אגרוז של כמה גנים הקשורים לארס, גנים של עמידות לאנטי-מיקרוביאלית וגנים סרוטיפ קפסולרי.
הערה: M, סמן DNA;1, blaKPC (893bp);2, entB (400bp);3, rmpA2 (609bp);4, rmpA (429bp);5, iucA (239bp);6, iutA (880bp);7, Aerobacterin (556bp);8, K1 (1283bp);9, K2 (641bp);10, כולם S (508bp);11, mrkD (340bp);12, fimH (609bp).
ERIC-PCR שימש לניתוח ההומולוגיה של 16 מבודדים CR-hvKP.לאחר הגברה של PCR ואגרוז ג'ל אלקטרופורזה, ישנם 3-9 שברי DNA.תוצאות טביעת האצבע הראו ש-16 מבודדים CR-hvKP היו פולימורפיים מאוד, והיו הבדלים ברורים בין הבידודים (איור 3).
בשנים האחרונות יש יותר ויותר דיווחים על מבודדים של CR-hvKP.המראה של מבודדי CR-hvKP מהווה איום גדול על בריאות הציבור מכיוון שהם יכולים לגרום לזיהומים חמורים וקשים לטיפול באנשים בריאים.במחקר זה, נבדקו השכיחות והמאפיינים האפידמיולוגיים המולקולריים של CR-hvKP בבית חולים שלישוני בשנגחאי משנת 2019 עד 2020 כדי להעריך האם קיים סיכון להתפרצות CR-hvKP ומגמת התפתחותה בתחום זה.יחד עם זאת, מחקר זה יכול לספק הערכה מקיפה יותר של הדבקות קלינית, שיש לה משמעות רבה למניעת התפשטות נוספת של מבודדים כאלה.
מחקר זה ניתח בדיעבד את ההתפלגות הקלינית ואת המגמה של CR-hvKP מ-2019 עד 2020. מ-2019 עד 2020, מבודדי CR-hvKP הראו מגמת עלייה.כ-31.2% (5/16) מ-CR-hvKP בודדו ב-2019, ו-68.8% (11/16) מ-CR-hvKP בודדו ב-2020, מה שעולה בקנה אחד עם מגמת העלייה של CR-hvKP שדווחה בספרות.מאז ג'אנג ואח'.תיאר לראשונה את CR-hvKP בשנת 2015,10 יותר ויותר ספרות CR-hvKP דווחה, 17-20 בעיקר באזור אסיה-פסיפיק, במיוחד בסין.CR-hvKP הוא חיידק על בעל ארסיות סופר ועמידות לריבוי תרופות.זה מזיק לבריאות האנשים ויש לו שיעור תמותה גבוה.לכן יש לשים לב ולנקוט באמצעים למניעת התפשטותו.
ניתוח העמידות לאנטיביוטיקה של 16 מבודדי CR-hvKP הראה שיעור גבוה של עמידות לאנטיביוטיקה.כל המבודדים טופלו באמפיצילין, אמפיצילין/סולבקטם, צפופרזון/סולבקטם, פיפרצילין/טזובקטם, צפזולין, צפורוקסים, צפטאזידיים, צפטריאקסון, צפפים, צפקקסיטין, אימיפנם ומרופנם עמידים.ל-Trimethoprim-sulfamethoxazole היה שיעור העמידות הנמוך ביותר (43.8%), ואחריו אמיקאצין (62.5%), גנטמיצין (68.8%) וציפרלקס (87.5%).שיעור ההתנגדות של CR-hmkp שנחקר על ידי Lingling Zhan ואחרים דומה למחקר זה [12].לחולים הנגועים ב-CR-hvKP יש מחלות בסיסיות רבות, חסינות נמוכה ויכולת עיקור עצמאית חלשה.לכן, טיפול בזמן המבוסס על תוצאות בדיקת הרגישות לאנטי-מיקרוביאלית חשוב מאוד.במידת הצורך, ניתן למצוא את האתר הנגוע ולטפל בו באמצעות ניקוז, פירוק ושיטות נוספות.
מבודדי 39 CR-hmKP חולקו לשתי קבוצות לפי אורך המיתר הדביק.ביניהם, 20 מבודדים CR-hmKP עם אורך מיתר צמיג ≤ 25 מ"מ חולקו לקבוצה אחת, ו-19 מבודדים CR-hmKP עם אורך מיתר צמיג> 25 מ"מ חולקו לקבוצה אחרת.בהשוואה בין השיעורים החיוביים של גנים הקשורים ל-CR-hmKP בין שתי הקבוצות, לא היה הבדל מובהק סטטיסטית בשיעורים החיוביים של גנים ארסיים בין שתי הקבוצות.מחקר של Lin Ze et al.הראה שהשיעור החיובי של גנים ארסיים של Klebsiella pneumoniae היה גבוה משמעותית מזה של Klebsiella pneumoniae הקלאסית.21 עם זאת, אם השיעור החיובי של גנים ארסים נמצא בקורלציה חיובית לאורך השרשרת הדביקה עדיין לא ברור.מחקרים אחרים הראו שה-Klebsiella pneumoniae הקלאסית עשויה להיות גם Klebsiella pneumoniae ארסית ביותר, עם שיעור חיובי גבוה יותר של גנים ארסיים.22 מחקר זה מצא כי שיעור חיובי הגן הארסיות של CR-hmKP אינו מתאם חיובי עם אורך הריר.מחרוזת (או לא גדלה עם אורך החוט הדביק).
טביעות האצבע של ERIC PCR של מחקר זה הן פולימורפיות, ואין הצלבה קלינית בין חולים, כך ש-16 חולים עם זיהום CR-hvKP הם מקרים ספורדיים.בעבר, רוב הזיהומים שנגרמו על ידי CR-hvKP דווחו כמקרים בודדים או ספורדיים, 23,24 והתפרצויות בקנה מידה קטן של CR-hvKP נדירות בספרות.11,25 ST11 הוא ה-ST11 הנפוץ ביותר בבידוד CRKP ו-CR-hvKP בסין.26,27 למרות ש-ST11 CR-hvKP היוו 87.5% (14/16) מ-16 הבידודים של CR-hvKP במחקר זה, לא ניתן להניח ש-14 זני ST11 CR-hvKP הם מאותו שיבוט, ולכן טביעת אצבע של ERIC PCR נדרש.ניתוח הומולוגיה.
במחקר זה, כל 16 החולים שנדבקו ב-CR-hvKP עברו ניתוח פולשני.על פי דיווחים, ההתפרצות הקטלנית של דלקת ריאות הקשורה בהנשמה הנגרמת על ידי CR-hvKP11 מצביעה על כך שהליכים פולשניים עשויים להגביר את הסיכון לזיהום CR-hvKP.במקביל, ל-16 חולים שנדבקו ב-CR-hvKP יש מחלות בסיסיות, מהן מחלות כלי דם במוח הנפוצות ביותר.מחקר קודם הראה שמחלת כלי דם במוח היא גורם סיכון בלתי תלוי משמעותי לזיהום CR-hvKP.28 הסיבה לתופעה זו עשויה להיות החסינות המוחלשת של חולים עם מחלת כלי דם במוח, לא ניתן לשלול את החיידקים הפתוגניים באופן עצמאי, ורק על ההשפעה החיידקית שלהם מסתמכים.אנטיביוטיקה תוביל לשילוב של עמידות לריבוי תרופות והיפר-ווירולנטיות בטווח הארוך.מבין 16 החולים, 9 מתו, ושיעור התמותה היה 56.3% (9/16).שיעור התמותה גבוה מ-10,12 במחקרים קודמים, ונמוך מ-11,21 שדווחו במחקרים קודמים.הגיל הממוצע של 16 חולים היה 83.1±10.5 שנים, מה שמצביע על כך שקשישים רגישים יותר ל-CR-hvKP.מחקרים קודמים הראו שצעירים רגישים יותר לזיהום.הארסיות של Klebsiella pneumoniae.29 עם זאת, מחקרים אחרים הראו כי קשישים רגישים למחלת Klebsiella pneumoniae הארסית ביותר24,28.מחקר זה תואם את זה.
בין 16 זני CR-hvKP, מלבד ST23 CR-hvKP אחד ואחד ST86 CR-hvKP, 14 הזנים האחרים הם כולם ST11 CR-hvKP.הסרוטיפ הקפסולרי המתאים ל-ST23 CR-hvKP הוא K1, והסרוטיפ הקפסולרי המקביל של ST86 CR-HVKP הוא K2, בדומה למחקרים קודמים.30-32 חולים שנדבקו ב-ST23 (K1) CR-hvKP או ST86 (K2) CR-hvKP מתו, ושיעור התמותה (100%) היה גבוה משמעותית מזה של חולים שנדבקו ב-ST11 CR-hvKP (50%).כפי שמוצג באיור 1, השיעור החיובי של זני ST23 (K1) או ST86 (K2) של גנים הקשורים לארסיות גבוה מזה של זני ST11 (K64).התמותה עשויה להיות קשורה לשיעור החיובי של גנים הקשורים לארסיות.במחקר זה, 16 זנים של CR-hvKP נושאים כולם את הגן carbapenemase blaKPC-2 ואת גן β-lactamase בעל הספקטרום המורחבת blaSHV.blaKPC-2 הוא הגן הנפוץ ביותר לקרבפנמז ב-CR-hvKP בסין.33 במחקר של Zhao וחב', 25blaSHV הוא גן β-lactamase בעל הספקטרום המורחב עם השיעור החיובי הגבוה ביותר.הגנים הארסים entB, fimH, rmpA2, iutA ו-iucA נמצאים בכל 16 הבידודים של CR-hvKP, ואחריהם mrkD (n=14), rmpA (n=13), אנאירוביצין (n=2), allS (n= 1), הדומה למחקר הקודם.34 כמה מחקרים הראו ש-rmpA ו-rmpA2 (מודנים של גנים פנוטיפ רירי) יכולים לקדם את הפרשת פוליסכרידים קפסולריים, מה שמוביל לפנוטיפים היפר-ריריים ולעלייה בארסיות.35 Aerobacterins מקודדים על ידי הגן iucABCD, והקולטנים ההומולוגיים שלהם מקודדים על ידי הגן iutA, כך שיש להם רמה גבוהה יותר של ארסיות במבחן הזיהום G. mellonella.allS הוא סמן של K1-ST23, לא ב-pLVPK, pLVPK הוא פלסמיד ארסי מסוג K2 super virulence.allS הוא מפעיל שעתוק מסוג HTH.ידוע כי גנים ארסיים אלו תורמים לארסיות ואחראים על קולוניזציה, פלישה ופתוגניות.36
מחקר זה מתאר את השכיחות והאפידמיולוגיה המולקולרית של CR-hvKP בשנחאי, סין.למרות שהזיהום שנגרם על ידי CR-hvKP הוא ספורדי, הוא עולה משנה לשנה.התוצאות תומכות במחקרים קודמים ומראות ש-ST11 CR-hvKP הוא ה-CR-hvKP הפופולרי ביותר בסין.ST23 ו-ST86 CR-hvKP הראו ארסיות גבוהה יותר מאשר ST11 CR-hvKP, למרות ששניהם הם Klebsiella pneumoniae ארסיים מאוד.ככל שהאחוז של Klebsiella pneumoniae הארסיות ביותר עולה, שיעור העמידות של Klebsiella pneumoniae עשוי לרדת, מה שיוביל לאופטימיות עיוורת בפרקטיקה הקלינית.לכן, יש צורך ללמוד את הארסיות ואת העמידות לתרופות של Klebsiella pneumoniae.
מחקר זה אושר על ידי ועדת האתיקה הרפואית של בית החולים החמישי של שנגחאי (מס' 104, 2020).דגימות קליניות הן חלק מהליכי מעבדה שגרתיים בבתי חולים.
תודה לכל הצוות של המעבדה המרכזית של בית החולים החמישי של שנגחאי על מתן הדרכה טכנית למחקר זה.
עבודה זו נתמכה על ידי הקרן למדעי הטבע של מחוז מינהנג, שנגחאי (מספר אישור: 2020MHZ039).
1. Navon-Venezia S, Kondratyeva K, Carattoli A. Klebsiella pneumoniae: המקור והמעבורת העולמית העיקרית לעמידות לאנטיביוטיקה.FEMS Microbiology Revised Edition 2017;41(3): 252–275.doi:10.1093/femsre/fux013
2. Prokesch BC, TeKippe M, Kim J וכו' אוסטאומיאליטיס ראשונית הנגרמת על ידי רעילות גבוהה.ה-Lancet נגוע ב-Dis.2016;16(9):e190–e195.doi:10.1016/S1473-3099(16)30021-4
3. Shon AS, Bajwa RPS, Russo TA.ארסיות גבוהה (סופר ריר).ארסיות של Klebsiella pneumoniae.2014;4(2): 107–118.doi:10.4161/viru.22718
4. Paczosa MK, Mecsas J. Klebsiella pneumoniae: המשך ההתקפה עם הגנה חזקה.Microbiol Mol Biol Rev. 2016;80(3):629–661.doi:10.1128/MMBR.00078-15
5. Fang C, Chuang Y, Shun C, et al.גנים ארסיים חדשים של Klebsiella pneumoniae הגורמים למורסה ראשונית בכבד ולסיבוכים גרורתיים של אלח דם.J Exp Med.2004;199(5):697–705.doi:10.1084/jem.20030857
6. Russo TA, Olson R, Fang CT וכו'. זיהוי של J Clin Microbiol, סמן ביולוגי המשמש להבדיל בין Klebsiella pneumoniae הארסיות ביותר לבין Klebsiella pneumoniae הקלאסיות.2018;56(9):e00776.
7. YCL, Cheng DL, Lin CL.מורסה בכבד Klebsiella pneumoniae הקשורה לדלקת אנדופטלמיטיס זיהומית.רופא מתמחה קשת.1986;146(10):1913-1916.doi:10.1001/archinte.1986.00360220057011
8. Chiu C, Lin D, Liaw Y. גרורתית ספטית אנדופטלמיטיס באבצס כבד מוגלתי.J גסטרואנטרולוגיה קלינית.1988;10(5):524–527.doi:10.1097/00004836-198810000-00009
9. Guo Yan, Wang Shun, Zhan Li וכו'. מאפיינים מיקרוביולוגיים וקליניים של מבודדי Klebsiella pneumoniae בעלי רירי גבוה הקשורים לזיהומים פולשניים בסין.התאים הקדם נגועים במיקרואורגניזמים.2017;7.
10. Zhang Yi, Zeng Jie, Liu Wei וכו'. הופעתו של זן ארסי ביותר של Klebsiella pneumoniae עמיד לקרבפנם בזיהומים קליניים בסין[J].זיהום J.2015;71(5): 553–560.doi:10.1016/j.jinf.2015.07.010
11. Gu De, Dong Nan, Zheng Zhong וכו'. התפרצות קטלנית של דלקת ריאות Klebsiella עמידה לקרבפנם ST11 בבית חולים סיני: מחקר אפידמיולוגי מולקולרי.ה-Lancet נגוע ב-Dis.2018;18(1):37–46.doi:10.1016/S1473-3099(17)30489-9
12. Zhan Li, Wang S, Guo Yan, et al.התפרצות של זן ST11 hypermucoid Klebsiella pneumoniae עמיד לקרבפנם בבית חולים שלישוני בסין.התאים הקדם נגועים במיקרואורגניזמים.2017;7.
13. FRE, Messai Y, Alouache S וכו'. ספקטרום ארסיות של Klebsiella pneumoniae ומודל רגישות לתרופות שבודדו מדגימות קליניות שונות[J].פתופיזיולוגיה.2013;61(5):209-216.doi:10.1016/j.patbio.2012.10.004
14. Turton JF, Perry C, Elgohari S וכו'. אפיון PCR והקלדה של Klebsiella pneumoniae תוך שימוש בספציפיות של סוג קפסולרי, מספר משתנה של חזרות טנדם ומטרות גנים ארסיות[J].J Med מיקרוביולוגיה.2010;59 (פרק 5): 541–547.doi:10.1099/jmm.0.015198-0
15. Brisse S, Passet V, Haugaard AB וכו'. רצף גנים Wzi, שיטה מהירה לקביעת סוג קפסולת Klebsiella[J].J מיקרוביולוגיה קלינית.2013;51(12):4073-4078.doi:10.1128/JCM.01924-13
16. Ranjbar R, Tabatabaee A, Behzadi P, וכו'. זני E. coli מבודדים מדגימות צואה שונות של בעלי חיים, גנוטייפ של גנים חוזרים ונשנים של enterobacteria consensus polymerase chain reaction (ERIC-PCR) [J].איראן ג'יי פאתול.2017;12(1): 25–34.doi:10.30699/ijp.2017.21506
זמן פרסום: 15 ביולי 2021